Hari Senin 30 Mei 2016, SMK Muhammadiyah 3 Yogyakarta menerima tamu kunjungan dari Sekolah Menengah Kebangsaan Berapit dan Sekolah Menengah Pendidikan Khas Persekutuan, Pulau Penang, Malaysia. Rombongan berjumlah 30 orang dengan diketuai oleh Kepala Sekolah SMK Berapit Bapak Teh Pang Eng. Semoga dengan silaturahim ini bisa lebih mempererat hubungan dunia pendidikan antara Indonesia dan Malaysia.
